Curso de doctorado en Bioinformática   Marzo-Abril, 2008 Universidad Autónoma de Madrid

Objetivos

El objetivo de este curso es proporcionar a los alumnos una base teórica y práctica de las principales aplicaciones y herramientas bioinformáticas disponibles actualmente. Por este motivo el programa del curso incluye formación teóorica, prácticas supervisadas con ordenadores en el aula y se propondrán problemas reales para resolver.

Dirigido por

Alfonso Valencia Programa de Biología Estructural y Biocomputación Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas (CNIO)

Joaquín Dopazo Departamento de Bioinformática Centro de Investigación Príncipe Felipe (CIPF)

Organizado por

Gonzalo Gómez (ggomez@cnio.es) & Osvaldo Graña (ograna@cnio.es)

Lugar donde se desarrollará el curso

25, 26, 28, 31 de Marzo, 2 y 21 de Abril: Sala 0 de la Facultad de Ciencias
7, 8 y 9 de Abril: Sala I de Informática de Ciencias Jurídicas (Fac. Derecho)

Programa

Martes 25 de Marzo

10:00-11:00	Introducción al curso Alfonso Valencia
11:00-12:00	Análisis de secuencias I Teoría    Práctica José María González-Izarzugaza (CNIO) & Juan Carlos Sánchez Ferrero (CNB)
12:15-14:00	Análisis de secuencias II Teoría    Práctica José María González-Izarzugaza (CNIO) & Juan Carlos Sánchez Ferrero (CNB)

Miércoles 26 de Marzo

10:00-12:00	Bases de datos José Manuel González, CNB
12:15-14:00	Identificación de familias de proteínas Luis Sánchez Pulido, CNB

Viernes 28 de Marzo

10:00-14:00

Predicción de estructura de proteínas Gonzalo López, Michael Tress & Iakes Ezkurdia, CNIO

Lunes 31 de Marzo

10:00-14:00

Predicción de genes Jan-Jaap Wesselink, CNIO

Miércoles 2 de Abril

10:00-12:00	Redes de regulación Guillermo Carbajosa, CNIO
12:15-14:00	Redes de interacción de proteínas Antonio Rausell, CNIO
	Prácticas

Lunes 7 de Abril

10:00-11:00	DNA Microarrays: Introduction Ignacio Medina, CIPF
11:00-12:00	Microarray Data Analysis: Normalization Ignacio Medina, CIPF
12:15-14:00	Microarray Data Analysis: Differential Gene Expression Ignacio Medina, CIPF

Martes 8 de Abril

10:00-11:00	Microarray Data Analysis: Predictors Ignacio Medina, CIPF
11:00-11:45	Microarray Data Analysis: Clustering Ignacio Medina, CIPF
12:15-12:45	Microarray Data Analysis: Introduction to Babelomics Ignacio Medina, CIPF
12:45-13:30	Microarray Data Analysis: Babelomics Ignacio Medina, CIPF
13:30-14:00	Microarray Data Analysis: Other tools Ignacio Medina, CIPF

Miércoles 9 de Abril

10:00-14:00

SNPs Arcadi Navarro, Universidad Pompeu Fabra

Lunes 21 de Abril

10:00-14:00	Filogenia Toni Gabaldón, CIPF
13:00-14:00	Ejercicios propuestos para la evaluación del curso